O arquipélago é um dos destinos mais isolados do mundo, com fontes termais naturais fumegantes, recifes, lagos e tubos de lava. Inclui várias praias dramáticas de areia preta e também a maior reserva marinha protegida da Europa (2024), que abrange a zona de maré em torno das ilhas até às planícies abissais, contendo corais de profundidade, mais de 450 (!) espécies de peixes de mais de 140 famílias, tubarões, tartarugas, baleias e golfinhos. Em suma, é também uma zona de grande biodiversidade marinha, de origem vulcânica.
"Esta parte do Oceano Atlântico, com as suas ricas zonas de pesca, oferece aos golfinhos e às baleias um ambiente nutritivo e um local protegido onde os animais podem dar à luz as suas crias perto das encostas das ilhas."
Até à sua proibição em 1987, a caça comercial à baleia ainda existia no Pico. Desde então, as baleias e os golfinhos ganharam importância, sobretudo como atracções turísticas. Parte da sua história é preservada na cidade portuária de São Roque com o museu da baleia a nas Lajes. Estes mesmos botes de madeira são agora utilizados para regatas, nos quais qualquer pessoa pode participar.
A época com mais hipóteses de avistar baleias é entre maio e outubro, especialmente em torno do Faial e do Pico. Esta parte do Oceano Atlântico, com as suas ricas zonas de pesca, oferece aos golfinhos e às baleias um ambiente nutritivo e um local protegido onde os animais podem dar à luz as suas crias perto das encostas das ilhas. No total, ocorrem cerca de 25 espécies. Também se efectua investigação nas ilhas, incluindo golfinhos de risso e botos (relacionados com a beluga e o narval).
Existem também muitas espécies de aves (principalmente migratórias), mais de 30 das quais utilizam o arquipélago como local de reprodução, tanto em torno da costa e das falésias como nas florestas de laurissilva mais para o interior.
E, talvez um pouco menos apelativo para a imaginação, há também todo um tipo de vida selvagem realmente extraordinária, incluindo vários moluscos (Gastropoda) e crustáceos (Crustacea), insectos como os aracnídeos (Arachnida) e centopeias (Chilopoda).
